Március és május között Santorini melegszik és kivilágosodik, az átlaghőmérséklet 16 és 24°C között alakul, és napi 7–11 óra napsütés várható. Tavasszal csökkenő esőzésekkel áprilisban és májusban ezek a hónapok ideálisak a sziget fővárosának felfedezésére, kevésbé azonban a strandolásra, mivel a tenger hőmérséklete májusig 17°C alatt marad.
Június és augusztus tiszta kék eget és a magas 20-as, alacsony 30-as fokozatú hőmérsékleteket hoz. Ha el akarod kerülni a nyári zsúfoltságot, a június a legjobb választás. Júliusra és augusztusra Fira már zsúfolt lesz, de a késő esti órákban a helyzet nyugodtabbá válik, amikor a hajós utasok elhagyják a várost.
Szeptember és október kellemes hőmérsékletet hoznak, 27 és 23°C között, és napi 10-7 óra napsütés. A tenger hőmérséklete az alacsony 20-as fokokban van, így ezek kiváló hónapok úszásra. Az esőzés októberben megnövekszik, de csak négy esős napra kell számítani 31-ből.
November és február között a hőmérséklet lehűl, 19-ről körülbelül 14°C-ra. Nagyobb az eső valószínűsége; január a legcsapadékosabb hónap 85 mm esővel. A napsütéses órák száma is a legalacsonyabb, átlagosan 4 óra. Azonban, ha szeretnéd látni a főváros hitelesebb oldalát, és nem zavar a tömeg, ezek vitathatatlanul a legjobb hónapok a látogatásra. Kevés hasonlóan gondolkodó utazó akad, így csak te és a helyiek maradtok.